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簡要描述:染色質免疫沉淀(CHIP)是一種用于表觀遺傳學研究的技術,可以快速反映蛋白質-DNA相互作用。

  • 更新時間:2025-02-17
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染色質免疫沉淀(CHIP)是一種用于表觀遺傳學研究的技術,可以快速反映蛋白質-DNA相互作用。

概念:染色質免疫沉淀法(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)是一種基于抗原抗體反應的特異性,從而起到選擇性地使DNA結合蛋白及其DNA靶標富集的作用,是在全基因組水平研究生命體組織或細胞內蛋白質與DNA相互作用的一種技術方法。

實驗原理

首先在活細胞狀態下固定蛋白質-DNA復合物,并將其隨機切斷為一定長度范圍內的染色質小片段,然后利用抗原抗體反應的特異性,特異性地富集目的蛋白結合的DNA片段,通過對目的片段的純化與檢測分析,獲得蛋白質與DNA相互作用的信息,可以真實地反映體內蛋白因子與基因組DNA結合的狀況。ChIP可用來研究某種特殊的蛋白-DNA相互作用、多種蛋白-DNA相互作用或全基因組或部分基因內的相互作用。

實驗步驟

細胞固定

甲醛交聯

染色質斷裂

超聲

免疫沉淀蛋白

和DNA復合物

用Protein-A/G Sephrose回收免疫沉淀

沉淀收集,洗滌,

解交聯

蛋白酶K/NaCl處理,接觸交聯

DNA純化

鑒定

CHIP



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